Sci Rep:5-miRNAID特征可作为食管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2022-02-07 05:00:43 来源:
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这项研究力图确定一种可以预期食管鳞状巨噬细胞胰脏(ESCC)高血压大体上生存率(OS)的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC高血压的miRNA表达五音及其相应的诊断信息,并将其作为训练集。在中期和晚期抽取外择优差异表达的miRNAs(DEmiRNAs)。用作Cox回归系统性、递归相似性去除(RFE)-支持乘积机(SVM)算法和LASSO Cox回归数学方法来识别结节病性miRNAs,从而建立结节病打分数学方法。此外,预期了这些结节病性miRNAs的有前途靶遗传,然后构建了miRNA靶遗传互联。通过功能富集系统性,系统性了ESCC之中这些结节病性miRNAs预期靶遗传的功能相关性。

在训练集之中,中期与晚期抽取有46个DEmiRNAs。建立了基于5个miRNAs的风险打分数学方法。该5-miRNA风险打分可以将训练集分为OS时外明显不同的高危组和低危组。在一个来自胰脏症遗传组图五音(TCGA)的独立信息集之中,成功验证了5-miRNA风险打分的风险分层能力。据悉了与这些miRNAs相关的各种生物学过程和闭环,例如Wnt信号闭环、TRP出口处的病变介质调节闭环和雌激素信号闭环。

这项研究提示,与病理分期相关的5-miRNA标签对预期ESCC高血压的结节病具有诊断意义。

早期出处:

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

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