厉害了，液体外科手术！cfDNA伴随诊断成功案例分析

前奏

除此以外，Grail马上注资10亿美元方案招集7000初诊白血病和3000 身体健康一些人，积极参与血检最初诊疗标记物的开发设计[1]。肝脏测试要激化了吗？从核心技术外行和可用者的本质吐槽一下黏稠活体的成果和前景。抛砖引玉。正文黏稠活体与基本上民间组织活体的优劣势相较之下前年末参加黏稠活体联席会议的时候，还觉得它离实际广泛应用还远，FDA的读物也含糊其词。一年多以前，早已有多款黏稠活体在在诊疗的产品获FDA许可，或早已受益数以百计诊疗图表，马上审报了。黏稠(肝脏) 活体的拓展真是可以用日新月初异来形容。黏稠活体主要包括肝脏之中的可逆肝细胞（circulating tumor cells，CTCs)， cell-free DNAs (cfDNA)， 外泌体（exosome）等。CTCs 火神了几年，在2013年抵达高峰后找到广泛应用有许多局限，被随之崛起的cfDNA取代。外泌体找到还相较之下新，虽然拓展随之，但离广泛应用还有英哩。这里主要咨询cfDNA的成果，主要是在在诊疗和药剂可实现上都的广泛应用。血检与民间组织测试相较优势在于：简便，快速，即时，价格便宜，微创。更加重要的是，血检需要保住许多民间组织电子束随之而来 (when tissue is an issue)，或民间组织电子束可用可用量、能可用量密度不高的高血压获取多肽麻醉药，或参与诊疗研究成果的期望。比如，完成将近30，000诊疗次测试的Guardant Health华盛顿邮报，血检工具保住了高50.2%的诊疗高血压的多肽特异性基因的接收者，这些高血压要么民间组织电子束随之而来，要么电子束能可用量密度不高，无法测试到DEHP特异性。不是所有肝细胞会将特异性的散落DNA释放到肝脏之中，多种不同大类的的血检检造出不下也不一致。据Guardant Health的华盛顿邮报，肝癌检造出不下最低，有约为92%，非小肝细胞前列腺癌89%，最低于的质母肝细胞瘤检造出不下只有57%。这是血检的最大的限制性硬伤之一。也是民间组织活体爱人都有价最大值的依据所在 (仍旧是金标准)。肝脏cfDNA测试还有许多其它挑战性状况，比如：· DNA片段小，50-200 bp（峰最大值165 bp）。· 半衰期短，30 分钟，最后稳定。· 高于含可用量/丰度：高于nM/mL 肝脏。· 随着治果的增大，DNA%-大幅缩减。· 正常肝细胞DNA的酸雨。血检在非小肝细胞前列腺癌的广泛应用随着核心技术的不断进步，血检早已取得庞大的事与愿违。血检成果平均速度和最成熟的也是尤其最迫切消费的是前列腺癌多肽麻醉药的在在诊疗。前列腺癌病患者多，死亡不下高，多肽药剂生产成果快。同时前列腺癌民间组织取样不简便，危险，容易诱导肺炎。前列腺癌诊疗医生和高血压对血检的消费是最积极的。前列腺癌血检成果平均速度的是EGFR敏感特异性的测试。EGFR特异性在欧美一些人分之二非小肝细胞前列腺癌的15%以上，是个相较之下多的高血压一些人。在欧美国家%-高25%以上。FDA明年早已许可了Roche的cobas血检试剂盒用作一线EGFR特异性的酪氨酸激酶多肽在在诊疗 (2016-6-1)，以及二线三代AZD9291（TAGRISSO）的在在诊疗 (2016-9-28)。根据早已刊发的EGFR T790M阳性高血压的图表，民间组织活体受益的动物模型图表相较之下应答不下（ORR）为62%，无成果生存期（PFS）为9.7个月初，血检的ORR为63%，PFS为9.7月初。二者图表颇为十分相似[2]。血检与民间组织活体完整性也极低。许多其它的美国公司的产品之中都引人注意注意EGFR的特异性测试。部分商业性血检试剂盒概要阿斯利康 (AZD) 花掉了大可用量的精力来测试三代AZD9291的则否病毒性特异性的系统，不断系统升级的简报图表标示出有约有20%的病毒性特异性由C797S特异性构成 (100 实有高血压图表)，即特异性了AZD9291的共价在手合位点。这个%-比早先的华盛顿邮报要高于[3]。欣慰更进一步的民间组织活体图表华盛顿邮报，可以相较之下二者的完整性。其它的特异性多为散乱分布。同时，AZD也在测试内在 (原发) 特异性的系统，更加多的图表在明年的AACR上必要有更加新。至于用NGS多混搭(panel) 测试，Guardant Health 在推造出Guardant 360后，又有利于推造出Guardian 500+， 与多个大型三洋美国公司协作，用作诊疗测试，检验潜在的相关特异性基因。这与NCI正要进行的伞式（umbrella）和篮式（basket）动物模型的远英哩是十分相似的。即大规模检验高血压一些人的可多肽特异性，推进，加快多肽药剂的可用和开发设计进程。当然，混搭也不是越大越好，如果入围的特异性基因不是转子DEHP特异性，或者不能多肽，不能对治疗提供诊疗内涵，内涵或许不小，徒增费用。NGS panel与PCR工具相较，代表了将来更加先进的核心技术。当前，可用者用多种不同美国公司的的产品得造出的在手果差异性还很大[4]。AZD的裂解部门的VP Carl Barrett 甚至给造出了几种主流的产品20%十分相似不下的最大值，令人大掉下巴。Barrett提到，正要用商业性的肝脏和民间组织电子束来相较之下多种不同美国公司的的产品的可靠性，在手果会在明年AACR年与会者披露。看来，相较PCR的工具，NGS在血检上还须要有利于此后进一步提高诱因和完整性。从可口可乐公司披露的ALK 揉合特异性3代ALK抗病毒Lorlatinib的肝脏cfDNA ALK特异性诊疗图表，我们需要受益哪些有用的接收者呢？他们用的是BEAMing dPCR 的工具[5]。引人注意感到译者对工具的可用性颇为不满，因为ALK的病毒性特异性大类较多，得随着诊疗成果不断优化PCR亚硫酸盐和反应状况。从38实有高血压的肝脏cfDNA之中，测试到有14实有高血压有ALK病毒性特异性。这个%-与早先华盛顿邮报的民间组织测试图表相当。同时，ALK的特异性大类，%-分布模式也与早先的华盛顿邮报类似。肝脏活体与早先的民间组织活体相较，需要测试到更加丰富的信号。特异性的系统性再次受益测试。早先民间组织安全检查的在手果，极寡病毒性特异性为ALK一般而言特异性，只有个别是双特异性。但肝脏测试到的在手果则标示出，有一半的高血压的ALK病毒性特异性等于或差不多2个特异性，超过的有4个特异性。Lorlatinib的ALK活性大幅进一步提高，比这一代ALK抗病毒Crizotinib的活性进一步提高了20-50倍，诊疗前图表声称，它需要抛开近乎所有的ALK病毒性特异性，引人注意对介导特异性L1196M有高的活性。但棘手地是，在所有引人注意注意L1196M的六实有特异性高血压之中，有三实有不属于必需反应，另外三实有优点不佳。根据早先的华盛顿邮报，优点不佳的高血压，有很大的先前是由于Src活性增大导致的内在抗药的系统复合引起的[6]。Src细胞内活性增大难以用基因测试的工具仔细观察到，勉强引导蛋白质组学的接收者。这也从侧面反映造出基因测试不是万能的，还要与其它必需的工具糅合，相辅相成。Lorlatinib的ALK病毒性特异性有一实有华盛顿邮报，即L1198F[7]。（肝脏活体的在手果之中还无法找到同样的特异性）这个新的病毒性特异性不能被二代ALK抗病毒抛开，却对这一代ALK抗病毒Crizotinib极其敏感，从而形成一个良性可逆 (loop) 服用选择，把恶性裂解成可高度集之中的慢性病。这必要是在找到再一治好方法早先我们对多肽麻醉药期望之中全然的“小远英哩”了。血检在在手直肉癌、肉前列腺癌上的广泛应用除了前列腺癌，中叶转移性在手直肉癌（mCRC）是血检拓展较快的。即KRAS特异性的测试。它不是用作KRAS本身的多肽（还无法必需的实际上多肽药剂，药剂矿物学家助威！），而是用来他的学生EGFR特异性服用 (如cetuximab)，即有RAS野生型的高血压对EGFR特异性必需，KRAS特异性的高血压优点则否着。瑞士的Merck在这个同方向最积极。与Sysmex所设计设计OncoBEAM测试科学仪器用作KRAS诊疗在在测试，与民间组织活体的完整性降到>92%[8]。与Biocartis所设计设计傻瓜型诊疗一体化科学仪器（研究成果用）。只要把1mL肝脏加入到测试科学仪器之中，130 分钟后基本功能造出在手果。号称10岁的**就可以加载。除了在在诊疗，KRAS血检还可以用作药剂治果，他的学生服用，停药决定。如有华盛顿邮报的发病，EGFR特异性可用导致野生型的RAS发生特异性，疾病成果后建议停止可用EGFR特异性，并可用其它治疗工具，等KRAS特异性测试排列成特征性后，可以此后可用EGFR特异性。这些简便，灵敏，对高血压的关系的RAS特异性状况的动态出现异常，正是血检的优势所在，受到医生高血压的高度重视。虽然KRAS特异性在非小肝细胞前列腺癌之中分之二的%-高25%以上，但由于无法必需的实际上多肽KRAS的药剂可以可用，所以KRAS特异性接收者在前列腺癌高血压之中对治疗的他的学生内涵当前还很有限，好在免疫麻醉药对KRAS特异性应答不下还不错。除此以外在EORTC-NCI-AACR联席会议上华盛顿邮报的肉前列腺癌（GISTs）的一期诊疗过程之中，全然地广泛应用了黏稠活体的方法，cKIT和PDGFR的病毒性特异性动态变化。Imatinib（Gleevec）在CML尤其但会神药的称号，但在在肉胃的多肽特异性上，却很快就产生了病毒性特异性。BLU-285和DCC-2618就是设计造出来的二代，用来抛开这一代的病毒性特异性。原则上血样黏稠活体需要第一时间，准确的诊疗药剂的可用优点[9]。看来，之后多肽病毒性动物模型的黏稠活体有日渐要成为标准测试之一的偏向。血检cfDNA的其它广泛应用前景随着cfDNA核心技术的不断进步和成熟，用原则上肝脏cfDNA电子束来大规模筛查罕不知转子DEHP特异性获取了极好的期望，比如TRKA， B， C 揉合特异性在近乎大极寡类型之中都有强调，但%-都不高[10]。这样，即使有极好的TRK多肽抗病毒，因为病患者招集颇为不简便，新药开发设计成果缓慢。如果原则上血检panel需要受益示范，新药诊疗开发设计可以大大提速。其它的实有子象在非小肝细胞前列腺癌，c-RET的揉合特异性有1-2%，c-MET 外显子14剪切特异性在前列腺癌有2-4%等，都是转子DEHP特异性，却因为病患者可用可用量相较之下较寡，严重阻碍了多肽药剂诊疗开发设计成果与获批[11]。癌症之中的PIK3CA 特异性，黑素瘤之中的BRAF（V600E）也是黏稠血检的研究成果热点。用肝脏cfDNA的方法来测试基因的过可用量强调还颇为不简便。很多时候，cfDNA的强调可用量与民间组织相应蛋白质强调含可用量不等于。像癌症的HER2测试可能还要更加多的举实有来说基本上民间组织测试方法。至于许多其他的类型，引人注意是DEHP特异性基因不清楚，多肽药剂缺乏的情况下，血检的重要性和首要任务还不是很引人注意。随着免疫麻醉药诊疗图表的不断积累，大规模的NGS血检图表也许可以辅助预判致病的概不下，用来他的学生潜在的服用混搭。这必要是颇为遥远的远英哩。再一，最具社会生活价最大值的广泛应用之一是白血病引人注意是前列腺癌的最初诊疗了。前列腺癌相较之下5年生存不下只有18%。如果需要最初找到，一期的五年生存不下高45-49%，二期也有30%。三期14%，四期只有1% (美国白血病联合会网站统计，2000年的不乏的最初图表，如今前列腺癌中叶生存不下必要进一步提高了很多，不知[11])。由于前列腺癌不属于看不到，摸不着的类型，同时最初前列腺癌时征状也不引人注意，导致了极寡高血压患病时已是中叶。黏稠血检最初诊疗还处在起步阶段，也是Grail要尽力的同方向。当然，泼冷水的也大有人在，指责他们好高骛远，没用高大上全， 不如来点实在的[1]。我觉得这是一个有前景的同方向，引人注意引人注意慈善Fund注资。