Nature：肠道微生物代谢产物新功能，促进HDAC3酵素

灵长类寄生虫和对其有益的伴生生物体的共同趋同导致了寄生虫-生物体关系的发展。一般说来遗传修饰使得灵长类线粒体很难统合外界周围环境接收器，加强线粒体对周围环境的优点。但是一直以来伴生的肠胃生物体比如说的多种接收器通路和多种周围环境接收器是如何精密管控的还不颇清楚。

肠胃血管壁位于生物体集合起来和寄生虫之间的界面，加强关键性屏障的逐步形成，在身体健康时期和损伤时期对肠胃角质层开展补充。维持肠胃血管壁分化过程之中有多种一般说来遗传有助于加入其之中，其之中HDACs的隐含对于肠胃稳态非常关键性。肠胃生物体比如说的短链脂肪酸乙酯长芦（Butyrate）在体外消除HDAC活性，乙酯长芦处理事件后的肠胃秘密组织血管壁之中HDAC活性下降。在新鲜兔之中脑产乙酯长芦的肠胃生物体则会消除肠胃血管壁之中HDAC的活性。这些结果都指明肠胃生物体比如说的乙酯长芦消除HDAC的活性。但是肠胃生物体与甲基化干与此相反受体活性之间的管控有助于是怎样的还不得而知。

近日，英国辛辛那提儿童医院医疗之中心Theresa Alenghat研究者室在Nature杂志上发表文章 Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut，辨认出肠胃生物体比如说的鸟苷羧酸长芦很难调节肠胃内甲基化干与此相反受体HDAC3的活性从而加强肠胃血管壁的大修，揭露了寄生虫对于肠胃生物体接收器鼓动的具体情况有助于。

为了揭露肠胃生物体衍生糖类产物与一般说来遗传接收器之间的关系，所写们对野生改进型以及肠胃血管壁HDAC3敲除肠胃之中的HDAC活性进性扫描，辨认出野生改进型非常少肠胃之中的HDAC3隐含也就是说并且具有稳定的受体活性，但是肠胃血管壁HDAC3敲除肠胃则反之亦然。所写们一切都是明白HDAC3是不是则会特异性调节肠胃生物体敏感的接收器抑止。所写们辨认出HDAC1与HDAC2在肠胃血管壁之中也有隐含，但并不能赔偿金肠胃血管壁之中HDAC3隐含的纠正。而且在对新鲜兔和肠胃血管壁HDAC3敲除肠胃之中的肠胃血管壁持续性HDAC广谱消除剂处理事件后，辨认出在HDAC3敲除后其他种类的HDACs基本上具有活性。这些结果指明肠胃生物体加强血管壁之中HDAC3在也就是说肠胃稳态之中的受体活性。

为了破解肠胃生物体启动时HDAC3的具体情况有助于，所写们对新鲜兔和也就是说培植的肠胃之中肠胃血管壁之中的转录谱开展解析。所写们辨认出在肠胃生物体共存的血管壁之中与鸟苷羧酸糖类就其的基因被广泛抑止隐含。前人的研究者辨认出鸟苷三羧酸（Inositol trisphosphate）则会通过强化HDAC3与启动时受体的相互作用来减低HDAC3的活性。所写们辨认出外加鸟苷三羧酸的确则会特异性减低HDAC3-NcoR重甲基化的活性，NcoR受体对于HDAC3的干与此相反受体活性非常关键性。

进一步地，所写们一切都是明白新鲜兔与非常少的肠胃肠胃之间鸟苷三羧酸高度是不是共存差异。所写们辨认出非常少肠胃之中无论是肠腔还是肠胃血管壁之中鸟苷三羧酸的高度都值得注意较低新鲜兔，指明肠胃生物体的共存加强鸟苷三羧酸高度的减低。为了检验鸟苷三羧酸对于肠胃血管壁之中HDAC3活性的影响，所写们对肠胃血管壁之中的HDAC3受体开展纯化并与鸟苷三羧酸开展共同一窝，辨认出鸟苷三羧酸的确很难减低内源HDAC3的活性。而且乙酯酮造成的HDAC3活性的消除也可以被鸟苷三羧酸所GABA。另外，所写们还辨认出伴生的肠胃生物体则会通过鸟苷六羧酸（Phytate）糖类除此以外加强肠胃血管壁之中的HDAC3的功能。与鸟苷三羧酸类似于，鸟苷六羧酸也则会抑止肠胃血管壁之中的HDAC3的活性。

为了扫描肠胃生物体鸟苷六羧酸依赖性的糖类对于HDAC活性的影响，所写们对定植野生改进型以及鸟苷六羧酸受体纠正改进型酵母菌的肠胃开展分析。所写们辨认出定植鸟苷六羧酸受体也就是说隐含酵母菌的肠胃相对来说于新鲜兔以及鸟苷六羧酸纠正改进型酵母菌肠胃的鸟苷三羧酸高度升高。对肠胃开展右旋糖酐酮磷（Dextran sodium sulfate， DSS）处理事件后，则会抑止肠胃转化成肠胃结核病。为了扫描鸟苷三羧酸在DSS处理事件抑止的肠胃结核病之中的作用，所写们对新鲜兔持续性鸟苷三羧酸后辨认出鸟苷三羧酸很难加强肠胃从结核病之中恢复并减低新鲜兔的寿命长。DSS抑止的细菌性类似于病人之中溃疡性细菌性。为了进一步确认肠胃生物体糖类产物的功能，所写们对人类统合生物体组学蓝图（Integrative Human Microbiome Project）之中的身体健康比对以及溃疡性细菌性患者的样本开展扫描，辨认出在溃疡性细菌性病人肠胃之中鸟苷六羧酸受体的丰度远低于身体健康比对之之中，指明鸟苷六羧酸对于肠胃损伤大修是必须的。

总的来说，Alenghat研究者室的岗位辨认出相对来说于新鲜兔，肠胃生物体共存的肠胃之中HDAC3活性值得注意减少，这一减少是通过伴生的肠胃生物体比如酵母菌鸟苷六羧酸以及鸟苷三羧酸的糖类逐步形成的。另外，鸟苷三羧酸则会抑止病人比如说的肠胃类人体器官的湿润、刺激HDAC3依赖性的线粒体增殖以及GABA乙酯酮引起的肠胃湿润消除，则会加强肠胃结核病之中血管壁的大修。因此，所写们比对辨认出了HDAC3作为寄生虫鼓动多种肠胃生物体接收器的汇聚一般说来生命体的不可或缺功能，揭露了肠胃生物体、一般说来生命体以及生物体糖类产物在肠胃角质层以及肠胃结核病之中的不可或缺管控和大修作用。

早期引自：

Shu-En Wu, Seika Hashimoto-Hill, Vivienne Woo, et al.Microbiota-derived metabolite promotes HDAC3 activity in the gut.Nature. 2020 Jul 30. doi: 10.1038/s41586-020-2604-2.